阿旺松绕等多名西藏统治高层官员很快被押解了过来。阿旺晋美语重心长地对垂头丧气的阿旺松绕劝解道：“阿旺松绕大人，现在悔悟还来的及呀！您千万别再执迷不悟了！和我们一起回到祖国的大家庭吧！”
阿旺松绕叹了一口气，此时已经插翅难逃的他无可奈何地道：“好吧，阿旺晋美，我答应汉人的条件，希望他们真的能言而有信。”
总指挥官和最高领导人的集体被俘更加让拉萨城内外的藏军斗志烟消云散，在接到阿旺松绕下达的“不许开枪，向汉军投降”的命令后，所有的藏兵立刻全部放下了武器。下午3时整，东北军第45旅的第777摩托化步兵团在没有遇到抵抗的情况下缓缓地进入了拉萨城区，汉语和藏语的欢呼声中，青天白日满地红国旗和东北军的红底黑色战斧军旗一起飘扬在了这座世界之巅的城市上空，标志着拉萨和绝大部分的西藏地区就此解放，重新回归到了中国中央政府（东北边防政府）的控制和领导下。
回归祖国怀抱后的西藏，经过东北边防政府的申请和武汉中央国民政府的批准后新建为“中国西藏自治区”，首府城市定为拉萨市，全区的政务权事全部高度自治（重大事情需要和中央政府通报请示）。4月15日，武汉中央国民政府宣布追封已故的达赖十三世大师为“护国弘化普慈圆觉大师”，追封已故的班禅九世大师为“佑民慈悲妙玄仁光大师”，并高度地赞扬了这两位西藏佛宗教派领袖的伟大爱国高风亮节和生前为国家团结、西藏发展所做出的巨大贡献；国民政府承诺将保留并绝对尊重西藏人民的宗教信仰和西藏“金瓶擎签”的灵童转世制度，规定西藏地方政府的行政和宗教最高领导人为达赖喇嘛活佛和班禅额尔德尼活佛；同时任命摄政达扎阿旺松绕为西藏自治区主席，阿沛阿旺晋美和五世格达活佛佛洛桑登真扎巴他耶大师两人共同担任西藏自治区的副主席。
在重新整顿安排了西藏政权教权的结构框架后，东北军第256、第257、第258、第270山地作战师等部队逐步入驻拉萨城和西藏的各个边防地区，并全力进行剿灭叛乱的西藏土司、地主等旧贵族的军事行动，以确保了西藏牢牢地控制在中央（东北）政府的手里；同时东北军招募藏人组建西藏边防军（即新藏军）和西藏的警察部队，其中新藏军下辖5个高原山地作战旅，总兵力约4万人，正副总司令分别由阿沛阿旺晋美中将（由武汉军委会军政部新授予的）和荆德文少将担任。
4月27日，西藏自治区主席摄政达扎阿旺松绕、副主席阿沛阿旺晋美、自治区政府高层官员凯墨索安旺堆、桑颇丹增顿珠、土登旦达、土登列门等人以及藏佛教宗代表五世格达活佛洛桑登真扎巴他耶大师等人组成西藏代表团，应全国陆海空三军副总司令兼国防部长张学良上将的邀请分乘数架东北军的“鸬鹚”军用运输机抵达沈阳，进行友好访问并就西藏今后的发展等诸多问题展开协商讨论会议。
在沈阳，摄政达扎阿旺松绕、阿沛阿旺晋美、五世格达活佛等人受到了张学良的亲自迎接和东北军政高层以及东北人民的热烈欢迎。经过十多天友好商谈后，双方签订了《中国东北边防政府与西藏自治区政府和平协定》、《奉藏友好共同发展四十六条》等协议条约；期间，他们还参观了举世闻名的东北“1号”重工业区和东北鞍山第一钢铁厂，在工厂的生产流水线车间里，西藏代表团成员们可谓大开眼界，因为过去的西藏根本没有工业，哪怕小型的工厂也没有。阿旺晋美羡慕地问张学良：“张将军，西藏也能建设工厂吗？”
张学良坚定地道：“能！只要我们万众一心，就能实现。”他又推心置腹地娓娓讲解道，“想必你们已经看到了，除了传统的农业外，工业也是必须要大力发展的，这样才能让一个国家、一个地区强盛发达起来，让人民过上幸福的生活。西藏由于位处高原地区，严峻的气候和地理条件都不适合重工业的发展，但是可以兴建起轻工业和中小型工厂。西藏蕴含的自然资源十分丰富，并且拥有世界第一的太阳能资源和地热资源…哦，就是你们的那些温泉呀！这些自然条件都应该好好地充分利用起来，为西藏人民造福呀！还有，西藏目前的封建农奴制度是十分落后和野蛮的，它严重地阻碍西藏生产力的发展和社会的进步，窒息了西藏社会的生机和活力，虽然它能让少数的西藏上层贵族过着穷奢极欲的生活，但是却让广大藏族人民生活在水深火热的贫穷困苦不堪之中，使得西藏的社会日益走向没落和衰败。所以，在西藏进行土地改革和现代化的工业建设是必然的。”
张学良转过身，又对格达活佛扎巴他耶大师诚恳道：“西藏人都是信奉佛教的，佛教有云‘众生平等’，而且我佛是大慈大悲的。那西藏的那些农奴百姓也应该得到平等仁慈的对待呀，也应该得到自己的土地、自己的牛羊，以及医疗、教育等权益呀！怎么能让占西藏95%以上的人民都终日过着被剥削压榨日子呢？这些都不符合佛祖的‘众生平等’和‘大慈大悲’精神呀！其实，解放了农奴，就是解放了西藏的生产力，也就是解放了西藏呀！”
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