而中国东北军在过去的两年内新攻占的领土包括中南自治东区（原越南、柬埔寨、老挝三国）、中南自治西区（原暹罗、缅甸两国），以及除了美属菲律宾群岛以外的整个东南亚地区（包括马来西亚、印度尼西亚、文莱、东帝汶、新加坡五国）和包括锡兰（斯里兰卡）、马尔代夫群岛、塞舌尔群岛以内的所有印度洋北部的岛国和群岛；以上地区的总面积大约为450万平方公里，人口约1.85亿。——并入中国版图的东南亚地区被中国东北政府划分为了如下的四大自治区和一个特别行政区：
东南亚自治西区，辖区包括西马来西亚半岛、苏门答腊岛以及邦加岛、勿里洞岛、明达威群岛、巴尼亚克群岛等附属诸岛，全区划分为七个省，原马来西亚国的首都吉隆坡市改名为吉州市，定为东南亚自治西区的首府，自治区行政主席由原马来西亚华侨领袖、著名的爱国华侨陈嘉庚先生担任；
东南亚自治中区，辖区包括文莱和整个婆罗洲（即加里曼丹岛），以及苏拉威西岛和图康伯西群岛、劳特岛、纳土纳群岛等附属诸岛，全区划分为四个省，原文莱国的首都斯里巴加湾改名为南海湾，定为东南亚自治中区的首府，自治区行政主席由原文莱国国王阿哈默德丹祖汀担任；
东南亚自治南区，辖区包括爪哇岛、努沙登加拉群岛、帝汶岛及巴巴群岛等附属诸岛，全区划分为五个省，原印度尼西亚国的首都雅加达市改名为雅州市，定为东南亚自治南区的首府，自治区行政主席由原印尼华侨领袖、著名的爱国华侨庄西言先生担任；
东南亚自治东区，辖区包括原印度尼西亚国所属的伊里安岛（新几里亚岛）的东部地区和塞兰岛、布鲁岛、多拉克岛以及马鲁古群岛、阿鲁科群岛、实珍群岛等附属诸岛，全区划分为三个省，原新几里亚岛的东部城市查亚普拉市改名为普州市，定为自治区的首府，自治区行政主席由原东北驻南京国民代表大会的资深参议员张扬先生担任。
新加坡则设立为中国新加坡特别行政区，成为继香港特区和澳门特区后的中国第三大特区城市；而锡兰（斯里兰卡）岛、马尔代夫群岛、安达曼群岛、尼巴科群岛、拉克沙群岛、塞舌尔群岛等印度洋北部诸岛统建为“中国北印度洋自治区”，全区划分为八个省，原锡兰国首都科伦坡市改名为亚门市（亚门，寓意为“亚洲门户”），设为北印度洋自治区的首府。
为了加强对东南亚这片辽阔领域的绝对控制权和永久性统治，中国东北军在这里长期驻扎有10个本土乙等师以及其他军区的直属部队，共计15万的兵力；并且东北边防部还命令各地自治区政府配合东北军的东南亚军区总司令部，在当地招募华人华侨陆续组建成拥有30个独立乙等旅、超过22万人的东南亚自治区守备军部队，用武装力量配合着文化渗透和经济控制等手段，将这里真正地融入大中国，东南亚地区的所有军队全部交由东南亚军区总司令王以哲上将和副总司令王树常上将指挥（两人刚刚由中将晋升为二级上将）。
值得一提的是，驻守在东南亚的东北军中有一支非常特殊的部队，它的正式番号是：中国国民革命军陆军特别新编第200师。这个师即原先东北军的“零号特战部队”，全师的一万余名官兵中，除了少部分东北籍的军事顾问和参谋军官之外，其余的上下成员清一色全部是纯血统的日本士兵，师长为毛忠华少将（日籍），副师长为张学良的胞弟张学曾少将。之所谓把这支特殊的部队调遣到东南亚，原因其实很简单，因为“零号部队”在目前中国国内的中日战争中能起到的作用已经是日益渐微了。把这些骨子里仍然凶残成性、嗜杀嗜血的日本兵派到东南亚的印度尼西亚、马来西亚等地剿灭游击队和镇压当地的反抗分子，完全是张学良的主意。他是这样想的：总所周知，日本兵不但擅长拼刺刀作战，更加喜欢干杀人放火、奸淫掳掠这些勾当，把这些无恶不作的人皮野兽派到历史上曾多次反华、排华的印尼、马来西亚等地自然是“物尽其才”，利用他们去“教训教训”当地那些不安分的印尼人、马来人，也算是为“历史上”那些惨死在南洋的华人华侨们出了一口恶气。既想狠下毒手做尽坏事，但又不想让东北军的本土士兵去沾染那些“脏事”，毕竟越南大屠杀这种事情做的太多了会让东北军这支军队的本质发生变化的，那么综上所述，派这些纯血统的日本兵前去实在是在适合不过了，正所谓“以毒攻毒、以恶止恶”，反正最后算起帐来也不会记到东北军的头上。而后来的事实证明，这一招效果非常明显，那些日本兵对干起烧杀奸淫等恶性之事自然是轻车熟路、得心应手，他们在中国大陆由于东北军的严加约束而不能发泄的凶暴残忍本性在东南亚得以尽情地一显无疑，个个干起来都十分地卖力。第200师所到之处，杀人、强奸、放火、抢劫、虐囚等恶事做了一路，使得印尼人和马来西亚人都对这支部队谈虎色变、闻风丧胆，一旦哪里的印尼人和马来西亚人知道这支部队被调到了自己家乡，纷纷争先恐后地逃离一空，当地的游击队和反抗活动也被迫偃旗息鼓。连王以哲上将都赞不绝口，称赞第200师在东南亚地区进行“镇压反叛、维持秩序”时“战功赫赫、硕果累累”，不但如此，该师还为东北政府从东南亚各地掠夺了超过200亿美元的财富。直至后来，日本最终战败并向中国投降，这支部队也“完成了历史使命”被解散了。但根据不完全统计，东北军特别新编第200师数年间在东南亚各地大概屠杀了超过二十万的印尼人、马来西亚人和菲律宾人，并犯下了上万起的强奸案、抢劫案、纵火案以及数不尽的虐囚丑闻，使得当地人心惊胆寒。
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